RNA-simple isolation Reagent-化学试剂

2024-07-24

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RNA-simple isolation Reagent

适用范围:常规动物组织(如:肝脏、心脏、肾脏、脑组织、骨骼肌等,不包括脾脏和肺脏)、植物组织(如水稻、玉米、拟南芥、烟草、小麦、大豆等,不包括棉花)、各类细胞系均具有很好的提取效果。保存条件:2-8℃提取试剂操作流程:

广泛适用于从各类动物组织、植物材料、培养细胞、细菌等 样品中提取 Total RNA 和Small RNA。与传统 Trizol 一样属于通用型 Total RNA 提取试剂,与 传统 Trizol 提取方法相比,本产品使用方法简单,不需要使用氯仿进行分层,且全程可在常温 进行;此外,本产品在高效地抑制 RNA 酶(Rnase)活性的同时,将蛋白质、DNA、多糖等杂 质沉淀到管底,从而实现单相提取,并有力保证了 RNA的完整度和纯度。使用本产品在 50min 内即可完成全部的提取过程,提取的 RNA 可以直接用于 cDNA 克隆、qRT-PCR 检测、mRNA 纯化、体外翻译、Northern blotting杂交、高通量测序等各种分子生物学实验。

使用方法1.样本处理1) 动物/植物组织① 将新鲜组织经液氮速冻后,迅速转移至液氮预冷的研钵中,用研杵研磨,期间不断加入液氮,直至研磨成粉末状(无明显可见颗粒)。▲研磨不全会影响 RNA 的得率和质量。② 将研磨成粉的样品转移至离心管中,大约每25mg组织加入500ul本试剂,剧烈振荡或移液枪吹打,使样品充分裂解。▲ 每500ul本试剂最多可以裂解50mg常规组织,过多的样本量可能会导致裂解不充分,并使产物纯度降低。▲部分韧性强或含较多外基质的组织,可能会出现不能全溶解的现象,在下一步操作RNA 提取的步骤 2)中将进入沉淀中,不会影响后续 RNA 提取及 RNA 质量。▲ 若没有条件用液氮研磨,可将新鲜组织尽量剪碎浸泡在本试剂中,用电动匀浆器高速匀浆至组织块全裂解。2) 悬浮细胞① 离心收集细胞,将获得的细胞沉淀用1×PBS重悬,再次离心,弃尽上清。② 加入本试剂,每1 - 5×106个细胞加入500ul本试剂。③ 用移液器反复吹打直至充分裂解。3) 贴壁细胞① 弃去细胞培养液,用1×PBS清洗一次。② 通常,每10cm直径的细胞培养皿培养的细胞加入2-3ml本试剂,常规六孔板(孔直径3.5cm)每孔加500ul本试剂,使之充分覆盖到细胞表面,然后用移液器将细胞吹打下来。▲对于贴壁牢固的细胞(细胞团)可采用细胞刮或洁净的枪头剥离,亦可在加入本试剂之前采用胰酶将细胞消化下来,然后按照悬浮细胞处理。③ 将裂解液转移至离心管中,用移液器反复吹打直至充分裂解。2.RNA提取1) 向上述裂解液中加入2/5体积的Rnase-free Water(每500ul本试剂使用200ul),上下颠倒混匀,室温静置5min。2) 12,000×g 室温离心15min。3) 取出离心管,此时溶液分成上层水相(含RNA)和深色的下层沉淀(含蛋白质、DNA、多糖等杂质),小心吸取上层水相至一个新的离心管中。▲上层水相的体积约占总体积的 90%,如用 500ul 本试剂进行提取,上层水相约为 640ul,建议吸取 500ul;针对微量的样本进行提取时,为减少 RNA 损失,可以全部转移上清。▲当样本的投入低于推荐量时,离心后可能不会出现下层沉淀,属于正常现象,可继续按后续步骤完成提取。4) 加入等体积异丙醇,上下颠倒混匀,室温静置10min。5) 12,000×g 室温离心10min,通常可以看见白色沉淀,小心弃去上清。▲部分组织材料由于含有较多的代谢产物,导致沉淀不能聚集而分散在离心管壁上,此时,请沿液面缓慢吸取上清。6) 加入500ul 75%乙醇(Rnase-free Water配制),轻弹管底让沉淀悬浮起来,并上下颠倒数次。7) 8,000×g 室温离心3min,弃去上清。8) 重复步骤6和7一遍,弃尽上清。▲为减少杂质残留,应尽可能的将上清弃干净。建议弃去大部分上清后,短暂离心将残留液体甩至管底,再用移液器将剩余液体全部吸掉。9) 室温放置晾干,加入适量的Rnase-free Water溶解沉淀,室温涡旋3min(或使用移液器反复吹打),使RNA沉淀充分溶解。提取的RNA产物可以分装后在-85~-65℃长期保存,在-30~ -15℃仅可短期保存。▲RNA 沉淀晾干 2-3min 即可,不要过度晾干,RNA 全干燥后会很难溶解。▲RNA 产物需要充分溶解,否则可能导致浓度定量失准以及 OD260/OD280 比值偏低。3.产物检测1) 产物纯度可用分光光度计检测,OD260/OD280比值在1.8-2.2之间表明RNA纯度较高。2) 产物浓度可以采用分光光度计检测,RNA浓度(ng/ul)=OD260×稀释倍数×40;或者采用Qubit直接检测。3) 取0.5- 1ug RNA,用1×TE或Rnase-free Water稀释至8ul,再加入1ul 10×DNA loading buffer,混匀,进行1%琼脂糖凝胶电泳;或采用2100检测,测定RNA产物的RIN值。

常见问题及解决方案

1.RNA发生降解RNA降解可能发生在多个环节,实验过程中需要注意以下事项:① 确保提取RNA的试剂和器具没有被Rnase污染,所有离心管、枪头及相关溶液都必须无Rnase污染,耐高温器物可于150℃烘烤4-6h以去除Rnase,其它器物可用0.1%DEPC水浸泡过夜;② 做好防护工作,戴口罩和一次性干净手套,并在单独的洁净区操作;③ 细胞或组织样品需立即加入本试剂,并迅速进行匀浆裂解。若处理不当,发生细胞或组织冻融,Rnase会被释放出来降解RNA。针对内源Rnase含量高或不易匀浆的组织,需将组织切成小块后立即投入液氮冷冻,然后进行研磨,在整个研磨过程中,样品不得融化;④ 提取的RNA样品需要妥善保存,建议取少量进行检测,其余样品分装于-85~-65℃保存。进行电泳检测可以提高电压并缩短跑胶时间,同时对电泳缓冲液进行冰浴降温,防止跑胶过程中RNA发生降解。2.出现污染① 蛋白质污染:采用分光光度计检测提取产物OD260/OD280偏低时,提示可能存在蛋白质污染。遇到此种情况,需要考是否组织投入量过大,导致裂解不充分,可以适当增加本试剂或者降低组织投入量进行提取;② 多糖污染:采用分光光度计检测提取产物OD260/OD230偏低时,提示可能存在多糖污染,需要考虑是否是因为乙醇未去除干净或者是组织投入量过大导致,此时,可以在RNA提取步骤9时适当延长RNA晾干时间或适当降低组织投入量进行提取操作;③ 脂肪污染:处理脂肪含量丰富的组织时,经过RNA提取步骤2之后,上层是大量脂肪,可以转移澄清的中间层进行下一步操作。3.加入异丙醇离心后看不见沉淀通常情况下,经过异丙醇沉淀可以看见白色沉淀。若遇到沉淀不可见的情况,可能是RNA含量低或者组织投入量过低,建议加入异丙醇(RNA提取步骤4)后在2~8℃或-30~-15℃放置10-30min后再离心;且在RNA提取步骤5进行弃上清操作时,请采用吸取而不是倾倒的方法,以免沉淀丢失。此外,部分组织材料由于含有较多的代谢产物,导致沉淀不能聚集而分散在离心管壁上,此时,请沿液面缓慢吸取上清。4.如何保存组织样本如果不能立刻提取 RNA,应将组织离体后迅速投入液氮冷冻,并用液氮保存;或液氮速冻后,转移至-85~-65℃保存。不能直接将新鲜组织放在-85~-65℃冷冻,因为样品的冻结是一个缓慢的过程,在这个过程中内源 Rnase 会将 RNA 降解。

本产品仅供科研使用,请勿用于临床诊断及其他用途

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